Η χειρουργική αφαίρεση του θυρεοειδούς αδένα παρουσιάζει γενικά χαμηλά ποσοστά επιπλοκών, όταν πραγματοποιείται από έναν έμπειρο χειρουργό του θυρεοειδούς.
Οι γενικές ανεπιθύμητες επιπλοκές του χειρουργείου του θυρεοειδούς που συνδέονται και με κάθε είδος χειρουργικής επέμβασης περιλαμβάνουν την αιμορραγία, τη μετεγχειρητική λοίμωξη αλλά και τις επιπλοκές που σχετίζονται με συνυπάρχοντα προβλήματα της υγείας του ασθενούς όπως τυχόν καρδιακές παθήσεις, αναπνευστικά προβλήματα όπως το άσθμα και η χρόνια αναπνευστική πνευμονοπάθεια.
